新编第三军在当天下午就收到了集结整备的将令，各部开始收拢人马，休假、探亲的人员也在收到将令后往回赶，整个讲武学堂连同第三军的驻地同时进行了军事管制和戒严。上海、苏州、杭州等地的军政司、府衙都忙碌了起来，各种粮食、弹药、物资通过各种渠道开始往温州运送。
温州经过数月的治理之后，已经恢复了秩序，西殿在这里的军事占领得到了百姓们的拥护，甚至很多富户士绅们也开始转而支持占领者。相比只会喝富户士绅血肉的清军来说，太平军在温州的做法好得太多了，至少没有强逼他们纳献钱粮，他们的财产得到了很好的保护。
不过和清军交往过密，甚至是办过团练对抗太平军的土豪劣绅就没有这么好的待遇，这些人被太平军从精神和肉体上完全进行了消除，财产、土地也被充公。
在温州接连开了十多次公审大会，罪大恶极的清军官吏、团练头目、土豪劣绅们被一批批的押上断头台。百姓们拍手称快，开明的士绅们弹冠相庆，幸亏当时自己没有头脑发热跟着清军和太平军作对。西殿正是用这种方式告诉其他地方的土豪劣绅们，和太平军作对会是什么下场。
在清除了地方几股团练势力之后，温州、台州等地变成了和宁波郡一样稳固的后方，温州郡也就及时的成立了。作为太平军对闽作战的前沿郡县，温州、台州汇聚了苏褔省大部分的物资，这些物资都是为前方准备的，这次新编第三军南下也不例外，温州依旧成了第三军的物资储备城市。
上海的第三军还没有出发，温州就已经开始接收属于第三军的物资了，大到宁波郡新近采购到的西洋火炮，小到湖州出产的单兵棉布子弹袋，战争让各地做生意的士绅百姓们都得到了大笔的钱财。
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