朱燮元就任四川巡抚后，也发挥了卓越的军事、政治才能，一改前任徐可求对土司的敌视态度。
原奢氏土司最富庶的土地，纳入朝廷永宁卫下辖，为官军直驻，其余土地则被他分设四十八屯，赐给土司军队中的平叛有功者。
四川当地，除奢氏外还有几家大土司。
朱燮元趁平叛余威仍在，将这几家大土司的土地分割开来，用战功封赏的由头分赐给一些有功的小土司将领，命他们每月向官府进献岁赋，称为“屯将”。
屯将的选派，往往要真正在平叛中为朝廷用命效力者，屯将们及其麾下军队也都直接隶属于地方州府。
朱燮元提出的四川屯将制度，实际上可以将那些土司军将领，逐渐转化为朝廷的直属将领，有力分割四川诸土司的力量。
前不久，朱燮元又向朝廷上疏，建议移叙州兵备道治所于永宁卫城，与贵州参将共同驻守。
朱由校仔细考虑后，准奏施行。
将近二载的时间，朱燮元已将四川境内的几家大土司分割为若干小土司，又将土地肥沃之处赐给忠于朝廷的小土司，设为屯将。
不安分的地方土司被逐渐“改土归流”，边缘、弱化，忠于朝廷的屯将们则成为土司军的主力军，因而彻底消除了四川地方土司的威胁。
自此，蜀中安定。
至于平定奢氏后，逐渐销声匿迹的贵州安邦彦，那又是朱燮元深深警惕的一个人。
只希望贵州巡抚王三善能招抚安邦彦，不让他再狗急跳墙，挑起战事，不然又要生灵涂炭。
……
“教化土司百姓，拜托诸位了！”
在诸生震惊的目光中，朱燮元弯腰下去，向他们深深作揖。
诸生本就听过这位四川巡抚安定蜀中，协讨奢乱的赫赫大名，很多人之所以选择四川，也有朱燮元的原因。
见状，无论来之前是打着什么目的，亦都是恭顺回礼，齐声道：“我等必不负抚台厚望，教化土民，亦足当平生一大快事！”
说完，门外忽然一阵蹄声。
却是自南京飞奔而来的王承恩，领着一行缇骑急匆匆地走了进来，人还没到，声音便就到了。
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