经过祖孙两人的深入探讨后，初步达成的协议如下：
首先是对本次征伐建州的文臣和武将们进行封赏。
像杜松这样的总兵，是没法在实际官职上再升了，只能加五军都督府的都督头衔，然后再加太子少保这样的荣誉头衔。其他的副将、参将等，基本都官升一级。
而殉国的柴国柱、张承荫等，自然是追晋一级并发给较为优厚的抚恤。
有新的军官晋升，就有老的军官退出。在这一年，大同总兵麻贵、四川总兵刘綎，都因为年龄原因致仕了。
在他们的接任人方面，原辽阳副总兵李如柏升任大同总兵。原横海卫指挥使麻承诏接任四川总兵。原宽甸卫指挥使萧伯芝出任辽阳副总兵。而作为太孙殿下耗费心血最多的两支卫所军，新的两位指挥使都是太孙钦点：出任宽甸卫指挥使的是刘綎的义子刘招孙，新的横海卫指挥使则是曹文诏。
本次征伐辽东的两位文臣，杨镐挂兵部尚书衔，出任蓟辽总督。而熊廷弼则是被调到了云南做巡抚——陈时济可比不上孙承宗，他一个人是罩不住木邦、孟养玉矿产业的。而且此时的暹罗已经开始发力了，大明必须提前在南方做好准备。
出于这个原因，宽甸卫全体战兵更是直接转换军籍到了云南：西南和东北的气候可完全不同，这些辽东汉子得提前去适应。
军官和文臣的封赏相对比较简单：官位的提升就能让很多人心满意足。但是对于普通士兵的赏赐，便是连朱由栋这样的土豪也感到肉痛。
大明以前的规矩：军功只算首级，作为普通一兵，你在战场上拿到首级后有两个选择，其一，升军官（得有空职位）。其二，得赏银。按照明代中后期的价格，一般是一个首级五十两。
这个制度在当时其实有一定的合理性。
因为长期拖欠军饷，导致各级军官为了保持战斗力，不得不把有限的资源拿来保证家丁。所以明朝各军镇往往是号称有多少万战兵，但真正能打的家丁也就是号称数量的几十分之一甚至百分之一。所以一场战斗下来，能有几百个首级都是难得的大捷。一个脑袋五十两，一次大捷也就是支付个几千万把两，这么算起来并不是太贵。
而这一次，大明官军们一共拿到了近两万个建州女真的首级……
虽说朱由栋在本次出战前就已经说好，战时不准割首级，战后统一评定。但无论如何，最终大家收拢的是两万个脑袋。所以这一块，朱由栋直接出了一百万两银子。
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