对于将军们而言，这还是小问题，让他们头疼的主要是粮食。虽然当初为了组织联军同戴奥尼亚开战，事先在城内囤积了不少粮食，但面对如此大的人口压力，依然感到吃紧。卡利斯特拉图斯等人不得不花费一番口舌，说服500人议会，然后组织人手，严控粮食的消耗。
此外，饮水也是一个问题。雅典地区本来有几条河流，但它们都在城区之外，在戴奥尼亚军队的控制之下，因此城内民众只能依靠城内的一个个水井，城内居民和城外难民经常因为争夺水井的使用权发生争执、甚至冲突，雅典政府不得不增派人手来维持每个水井的取水秩序。
而在这个期间，几名曾经多次参加戴奥尼亚学园医学院举办的希腊医学论坛的雅典医生一起向雅典政府提出警告：必须要尽力保证城内的清洁，否则太过肮脏的环境会导致瘟疫的发生。
他们的建议引起了将军执行委员会的重视，要知道当年伯罗奔尼撒战争开始之后，斯巴达联军从陆路进攻雅典，当时雅典也是据城防御，情况和今天并无太大不同，但没过多久城内就发生了一场大瘟疫，伯里克利也染病故去。虽然这几名医生声称“他们所了解到的这些知识都是学自戴奥尼亚医学院”，但雅典将军们并没有因此而忽视，毕竟这些年戴奥尼亚的医学水平高已经逐渐得到东地中海的一些城邦的认同，而且瘟疫给雅典人造成的噩梦太过可怕，因此即使是仇敌，卡利斯特拉图斯等人仍然决定采纳他们的建议，派出大量人手，每天负责清理街道，尽力保证城市的清洁。
还没有正式交战，以卡利斯特拉图斯为首的雅典高层就已经因为城内暴增的行政事务而心力交瘁，而民众也在紧张、恐慌和忙碌中艰难的度过每一天。
但是戴奥尼亚的军队依然没有发起进攻，只有各军团的弩炮队在帕特洛克罗斯的命令下，均匀分布在雅典城周围，开始大量的向雅典城内发射小型的石弹，这些石弹不断越过城墙，砸坏附近的房屋，造成雅典民众的恐慌，迫使他们远离城墙，更造成了城区中央的拥挤。
为了保证士兵们上下城墙不受阻碍，雅典官员们还不得不安排奴隶去清理城墙附近的这些被石弹轰击所造成的废墟，没多久就不断有人向市政厅密报，说“家里的奴隶多次悄悄出去，和其他的奴隶秘密集会，行踪诡秘。”
市政厅立即派出巡逻队，抓捕了一些奴隶进行审问，结果令人大吃一惊，原来那些负责清理城墙附近废墟的奴隶发现射入城内的石弹几乎都刻有希腊文字，主要意思就是“只要奴隶敢于起来反抗他们的主人和城邦，协助戴奥尼亚军队攻破城池，戴奥尼亚不但将给予他们自由，甚至还会分给他们土地……”
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